โรงเรียนคงคารามได้กำเนิดมาจากพระภิกษุ ในวัด ที่เปิดสอนอักขรวิธีให้ศิษย์สามเณรและเด็กที่อยู่ใกล้วัด เมื่อปี พ.ศ.2444 มีหลักฐานว่า พระสุวรรณมุนีนรสีห์ธรรมทายาทสังฆปาโมกข์(หลวงปู่ฉุย)ได้ทุ่มเทกำลังสอน หนังสือไทย แก่ผู้มาฝึกวิปัสสนาเป็นจำนวนมาก จนต้องหาครูมาช่วยสอนจัดตั้งเป็นโรงเรียนขึ้น จนเจริญขึ้นเป็นลำดับ